中国科大在动物长链非编码 RNA 研究中取得进展

来源: 中国科学技术大学 / 作者: cas / 时间: 2019-01-10
0 1

中国科学技术大学生命科学学院非编码 RNA 功能及功能机理研究团队近日在国际期刊《基因组生物学》(Genome Biology)发表了题为 Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants 的文章,报道了实验室最新的研究成果。该实验室通过优化的基因编辑技术,对秀丽线虫中 155 个基因间的长链非编码 RNA(lincRNA) 进行逐一敲除(秀丽线虫已知的全部 lincRNA 共 170 个),系统地研究了秀丽线虫中 lincRNA 的功能。这是第一篇在多细胞动物中利用基因编辑技术、在全基因组水平上、对一个种类的长非编码 RNA 进行敲除并系统分析其在动物中生理功能及功能机理的研究。

他们对 155 个 lincRNA 敲除突变体进行六个方面表型的筛选发现,23 个 lincRNA 突变体分别在其中一个或者两个生理表型上具有不同程度的缺陷。通过对秀丽线虫不同发育时期的转录组测序进行分析,研究了 lincRNA 和 mRNA 共表达情况,同时建立了 lincRNA 和 microRNA 共表达及调控网络。通过对秀丽线虫不同发育时期近 300 个转录因子的分析来探究转录因子在线虫不同发育阶段对 lincRNA 表达的调控,进而研究了这 23 个 lincRNA 行使其生理调控功能的机理。

该研究系统地探索了 lincRNA 在多细胞动物中的生理功能,一定程度拓宽了 lincRNA 研究领域。同时该研究获得的 lincRNA 敲除线虫株,为后续进一步研究长链非编码 RNA 在衰老和疾病等中的作用提供了有力支持。文章的共同第一作者是博士生卫帅、博士后陈禾和最近博士毕业的国际学生 Emmanuel Enoch Dzakah,通讯作者为中国科大教授单革。

该研究得到科技部、国家基金委和中科院 “衰老的生物学基础和干预策略” 先导科技专项(培育)的经费支持。

声明:本网所有文章(包括图片和音视频资料)系出于传递更多信息之目的,且明确注明来源和作者,不希望被转载的媒体或个人可与我们联系(edit@bio360.net ),我们将立即进行删除处理。所有文章仅代表作者观点,不代表本站立场。

文章评论(0)
使用匿名身份评论
  • 暂无评论,请抢占。