高质量油菜基因组图谱发布

来源: 中国科学报 / 作者: 2020-01-21
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近日,《自然—植物》在线发布了 8 个甘蓝型油菜品种(材料)的高质量参考基因组。华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室油菜团队与生物信息团队以此为基础解析了油菜生态型分化的遗传和分子基础。该研究为进一步解析甘蓝型油菜基因组结构、加速油菜品种改良提供了重要资源,对农艺性状基因定位和克隆有重要意义。

油菜是异源四倍体作物,具有复杂的基因组,已发布油菜参考基因组的质量和代表性难以满足油菜功能基因组学研究和遗传改良的需求。因此,该研究通过整合数据,对 8 个代表性甘蓝型油菜的基因组进行了组装和注释。

该研究还以共线性直系同源基因为纽带首次构建了油菜种内索引。通过比较基因组学方法,绘制了 8 个基因组的综合变异图谱,这些变异对油菜至少 9.4% 的编码基因产生了大效应影响。油菜泛基因组和核心基因组架构为功能基因研究和遗传育种提供了新的重要资源。

相关论文信息:http://doi.org/10.1038/s41477-019-0577-7

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