我科学家完成海湾紫扇贝基因组测序和组装

来源: 科技日报 / 作者: 2020-03-26
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科技日报青岛 3 月 25 日电 (记者王健高 通讯员周维维)25 日,记者从青岛农业大学获悉,该校海洋科学与工程学院王春德教授课题组与合作单位自主研发完成海湾扇贝两个亚种的基因组测序和组装。近日,相关研究成果在线发表在 Nature 旗下开源期刊 Scientific Data 上。

此前,王春德课题组已完成紫扇贝基因组的测序和组装。紫扇贝和海湾扇贝两个亚种基因组的成功测序,为从分子水平解析海湾扇贝属扇贝及其杂交后代的生长、抗逆性、育性和寿命等重要性状的决定机制及分子育种,打下了基础。

王春德表示,此次他们科研团队在扇贝育种研究方面再次取得重要进展,成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组的测序和分析。

王春德介绍,海湾扇贝属(Argopecten)是原产于美洲的雌雄同体型扇贝,大部分种类分布在北大西洋沿岸,其中海湾扇贝北部亚种和海湾扇贝南部亚种(又称墨西哥湾扇贝)已由张福绥院士分别于 1982 年和 1991 年由美国引进我国,成为我国北方和南方海域主要扇贝养殖品种。紫扇贝是唯一分布于南太平洋沿岸的海湾扇贝属种类,2007 年由王春德教授课题组首次从秘鲁引进我国。近年来,课题组通过将紫扇贝与海湾扇贝两个亚种分别进行杂交,成功培育出一系列生长优势极其显著的杂交扇贝新品种(品系),其中扇贝 “渤海红”“青农 2 号” 和“青农金贝”已获得国家水产新品种证书,成为我国北方的主要扇贝养殖品种,并在福建、广西和广东等南方海域养殖成功。

王春德课题组利用二代和三代测序相结合的方法测序并组装了海湾扇贝两个亚种的基因组。系统进化分析显示,海湾扇贝两个亚种先聚为一支,然后与虾夷扇贝聚为一支,再与其他双壳类聚为一支,然后再与腹足纲物种聚类。两个海湾扇贝亚种的分歧时间为 2640 万年前,与虾夷扇贝的分歧时间为 8590 万年前。

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