Nature 不再让悲剧发生:285 个与发育障碍相关联的基因

来源: 生物通 / 作者: 万纹 / 时间: 2020-10-15
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全球范围内,每年大约有 40 万婴儿会携带新发突变(De novo mutations)出生,这些突变会影响婴儿的发育,导致诸如智力残疾,癫痫,自闭症或心脏缺陷等疾病。

一项由 Wellcome Sanger 研究所,荷兰奈梅亨大学医学中心等处的研究人员完成的最新研究鉴定出与这些疾病相关的 285 个基因,包括 28 个新相关的基因。

这一发现公布在 10 月 14 日 Nature 杂志上,该研究将为约 500 个有罕见病儿童的家庭提供诊断。

研究人员整理了众多医疗保健和研究数据,创建最大的可用于发育障碍研究的遗传资源库。数据分析预计还有约 1,000 个与发育障碍相关的基因尚待发现。

基因新发突变是发育障碍的公认原因,但是迄今为止,与这些障碍相关的许多基因仍然未知。每个人出生时平均大约有 60 个新发突变,不过绝大多数不会导致健康问题。

现在许多科研项目,如 Deciphering Developmental Disorders (DDD) 都在通过寻找患有这些疾病的人的基因组模式来发现了相关基因。但是由于许多情况极为罕见,因此用于定位这些基因的统计分析需要大量匿名患者数据,而这些数据并不总是很容易获得。

在最新研究中,研究人员分析了 31,058 个外显子组序列 “trios”。每个 trios 都包含来自发育障碍儿童的序列,以及他们的父母双方的序列。

样本是通过结合来自 Sanger 研究所,奈梅亨大学和 GeneDx 的现有研究数据和临床数据集而创建的。

这些数据集的规模极大地提高了可用于搜索先前未发现的突变的统计能力。然后,作者使用改进的统计检验来确定研究中的个体在同一基因中的突变是否比他们偶然发生的突变更多。

文章一作 Kaitlin Samocha 博士说:“根据以前的研究,我们知道某些基因和突变类型与发育障碍有更紧密的联系,这使我们可以缩小搜索范围。更大的数据集,使我们能够鉴定与发育障碍相关的 28 个新基因。”

Helen Firth 博士说:“照顾有发育障碍的孩子对家庭来说可能是极具挑战性的,尤其是当孩子的医生不知道是什么原因导致他们的病情,而无法进行治疗时。详细诊断可以为孩子提供治疗信息,帮助他们了解再生孩子的风险。”

该研究还对数据应用了统计建模,预计大约还有 1,000 多与发育障碍相关的基因尚未发现。大约有 60% 患有疾病的儿童没有诊断。

Sanger 研究所 Matthew Hurles 教授说:“这项研究确实展示了获得医疗保健数据的好处,我们的发现还估计,我们需要十倍的数据才能鉴定与发育障碍有关的所有基因,因此,更多的匿名患者数据对于我们了解这些疾病和帮助与他们相同的家庭至关重要。”

英国基因组学首席科学家 Mark Caulfield 教授说:“这项研究表明,将基因组数据与医疗保健数据相结合,有助于获得可改善患者预后的基因新见解。在实验室中,基因组学正在带来直接影响患者及其家人的医疗保健方面的实质性进步。我们必须做更多的工作才能使匿名患者数据可用于研究。”

原文链接:

http://dx.doi.org/10.1038/s41586-020-2832-5

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