中国农科院特产所首次破译鹿科动物全基因组序列

中国科学报 / 王冬昭 贾禾 / 2017-11-15
0 3

近日,由中国农业科学院特产研究所研究员李光玉带领创新团队在国际上首次破译鹿科动物全基因组序列。驯鹿全基因组测序的完成,不仅为研究人员从基因组水平挖掘驯鹿生长、代谢和抗寒等重要性状的分子机制提供了科学指导,而且为驯鹿驯化历史、基因组演化、群体遗传及鹿类动物的进化等理论研究奠定了重要基础。相关研究成果于 11 月 1 日在线发表在 GigaScience 上。

我国是鹿类动物资源最为丰富的国家,分布约有 20 种鹿类动物,而驯鹿是最具代表性的鹿科动物之一,是鹿科物种中唯一被驯化、雌雄个体均生长鹿角的动物。鉴于该物种独特的生物学特征和重要的科研价值,研究人员对一只雌性驯鹿进行了全基因组测序并获得了高质量的组装序列,基因组大小为 2.64Gb,Contig N50 和 Scaffold N50 分别为 89.7kb 和 0.94 Mb;基于同源比较和从头预测的方法,注释得到了 21555 个蛋白编码基因、159 个 rRNA、863 个 tRNA、547 个 miRNA 和 1339 个 snRNA。系统发育分析表明,驯鹿与牛科物种的分化时间大约在 2950 万年前,进一步的比较基因组学分析识别了 335 个驯鹿所特有的基因家族。

该项研究得到了中国农科院科技创新工程和国家自然科学基金等项目的资助,研究成果在线预发表期间即受到了广泛关注,并且荣获第十二届国际基因组大会 GigaScience 前沿研究奖。

声明:本网所有文章(包括图片和音视频资料)系出于传递更多信息之目的,且明确注明来源和作者,不希望被转载的媒体或个人可与我们联系(edit@bio360.net ),我们将立即进行删除处理。所有文章仅代表作者观点,不代表本站立场。

文章评论(0)
使用匿名身份评论
  • 暂无评论,请抢占。