TCGA 及其他公共数据库(SEER、METABRIC)挖掘与应用研讨班

2017-07-08 至 2017-07-09 美国 | 北京 复制 谢老师 wybiot@126.com  复制

TCGA 及其他公共数据库(SEER、METABRIC)挖掘与应用研讨班

玮瑜主办 2017 年 7 月 8 日 - 9 日(周六日) 北京

课程简介

随着大数据时代的到来,各种生物医学公共数据库井喷式涌现,其中就包括癌症领域熟为人知的癌症基因组图谱 TCGA 数据库。TCGA 为肿瘤基础医学和转化医学研究者提供了海量的基因组数据和与其关联的临床数据,为挖掘有意义的基因组变化和发现影响肿瘤起始、发展、转移等生物学机制提供了海量数据。此外,其他诸多公共数据库(SEER、METABRIC)也为肿瘤研究者提供了绝佳的基础和临床数据宝藏。

然而,传统的基础医学和转化医学研究者缺乏信息学基础来处理大规模癌症数据,因而在面对这些极有价值的组学和临床数据时,往往心有余而力不足。作为医学信息领域研究者,我们需要将信息学和统计学知识运用到癌症基因组学数据分析的研究当中,构建连接大数据与基础医学研究者之间的纽带,帮助研究者去更好地挖掘探索这些数据。

课程内容、目标与特色

本次培训提供了一次系统了解 TCGA、SEER、METABRIC 等数据产生、糅合、分析及挖掘的课程, 使基础医学和转化医学研究者能更好地挖掘 TCGA 多组学数据,以便为自身科研项目服务。

本次培训涵盖拟解决的问题包括:

1、如何基于 TCGA 及其他公共数据库(SEER、METABRIC)设计课题;

2、TCGA 各组学数据及其他公共数据下载;

2、获取数据后如何分析。

考虑到传统的基础医学和转化医学研究者缺乏利用公共数据库进行数据挖掘的经验本次学习班采用傻瓜实用式教学法,理论培训结合上机实战,与各位学员共同探讨如何利用大规模公共癌症数据助力科研。

授课老师

本次主讲老师是来自三甲医院临床医生和科研工作者,有着丰富的临床和转化研究经验,已发表主流 SCI 论文 30 余篇,其中成功用 TCGA、SEER 等数据库发表十几篇 SCI,平均 4 - 5 分一篇。

课程设置

第一天上午:TCGA 数据库入门

TCGA 数据库基本概念介绍及数据获取

几篇基于 TCGA 数据库发表文章的深度解析

上机实战:TCGA 数据如何获取

基于 TCGA 数据库课题设计讨论

第一天下午:组学研究课题设计与常用统计方法

高通量测序与组学研究入门

精准医学时代的肿瘤组学研究介绍

实用科研统计方法介绍

上机实战:实用科研统计方法实战

第二天上午:TCGA 数据深度挖掘

如何利用 TCGA 进行数据挖掘及临床转化课题设计

上机实战:基于 TCGA 数据处理和分析实战

第二天下午:其他公共数据库(SEER、METABRIC)

SEER 数据库入门(软件安装、数据获取、数据检索)

几篇基于 SEER 数据库发表文章的深度解析

如何利用 METABRIC 数据库进行数据挖掘及课题设计

上机实战:SEER 数据库、METABRIC 数据库数据处理和分析

TCGA 数据库及其他公共数据库(SEER、METABRIC)相互比较

备注:自带笔记本电脑,安装 WINDOWS 操作系统,需要 SPSS、GraphPad Prism 5、以及 Office Excel 2007 等软件。

主办单位

上海玮瑜生物科技有限公司

时间地点

会务时间:2017 年 7 月 8 日 - 9 日 7 日报到

会务地点:宝林轩国际大酒店(北京西站南路 80 号)

住宿:(没有强行规定,可以自订酒店,住宿费用自理)

北京宝林轩国际大酒店,标准间(含早)380 元 / 人、合住 190 元 / 人,费用自理。合住的学员最后出现单人无法安排的情况,需要自补房间差价。

注册费用

2400 元 / 人。 授课期间发放纸质邀请函(盖章)和发票。按交费先后顺序确定座位号。会务期间提供午餐,晚餐自理。

付款方式

1,转账或支付宝:您可以按照下面的指定账号放心汇款,汇款前您也可以和招生老师核对账户

2,现场刷卡或现金:您也可以现场刷卡和支付现金。

A:汇款账户

账户名称:上海服淡信息科技有限公司 账户号:31578103002581719

开户行:上海银行桃浦支行

B:支付宝转账

收款人:wybiot@163.com

户名:上海玮瑜生物科技有限公司

汇款时写上您的姓名,如果朋友代付一定要注明您本人的名字,便于好查询。

疑问咨询

联系人:谢老师 13611825136

报名邮箱:wybiot@126.com

报名方法

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